Malabarese Katolik Kilisesi, 15. yüzyılın sonunda Goa'nın Portekiz kolonileşmesinden sonra Roma ile birleşen Güney Hindistan'ın (Kerala) bir Kilise ayini kilisesi. Portekizliler, 6. yüzyıldan beri Roma ile geleneksel uyumlarına rağmen, bu St. Thomas Hıristiyanlarını kendilerini Nestorian sapkın olarak adlandırdılar. Malabarese, 1599'da Diamper Sinodundaki papayı resmi olarak kabul etmesine rağmen, Portekizliler onları yoğun Latinizasyona maruz bıraktı. Malabarese 1653'te Roma'dan koparak tepki gösterdi. Sadece Suriye piskoposu Sebastiani 1661'de kurulduğunda şizmatik Malabarese'nin çoğu Roma Katolik kilisesine geri döndü. Kalanlar Antakya Suriye Ortodoks (Jacobite) patriğine bağlıydı.
Malabarese Katoliklerine 1877'de Latin ayini Hint Katoliklerinden ayrı yöneticiler verildi ve 1923'te kendi hiyerarşilerini geri kazandı. Doğu Süryani'yi edebi dil olarak kullanıyorlar.