Jel Filtrasyonu olarak da adlandırılan jel kromatografisi, analitik kimyada, gözenekli, yarı katı bir maddenin yatağından geçme hızlarındaki farklılıkları kullanarak kimyasal maddeleri ayırma tekniği. Yöntem, enzimleri, proteinleri, peptidleri ve amino asitleri birbirinden ve düşük molekül ağırlıklı maddelerden ayırmak için özellikle yararlıdır. Bir karışımın bileşenlerinin jel kromatografisiyle ayrılması, bileşenlerin moleküler boyutlarındaki farklılıklara dayanır. Küçük moleküller, gözenekli partiküllerin içine yayılma eğilimindedir, böylece akışları kısıtlanırken, büyük moleküller gözeneklere giremez ve engelsiz akma eğilimindedir. Böylece, en yüksek moleküler ağırlığa sahip bileşenler önce yatağı terk eder, ardından arka arkaya daha küçük moleküller gelir. En yaygın olarak kullanılan yatak malzemeleri poliakrilamid ve dekstran ve epiklorohidrinden hazırlanan bir polimerdir. Kuru polimerler genellikle homojen, yarı katı bir karışım oluşturmak üzere uygun ajanlar içinde süspanse edilir.