Mersey NehriGoyt ve Tame'nin kavşağında, Stockport, Eng. Mersey, Lancashire ve Cheshire ovalarının geniş alanlarını boşaltan, 45 metrenin (150 feet) tamamen altındadır. Manchester'ın güney banliyölerinden batıya doğru akar ve Flixton'da büyük sağ banka kolu Irwell'i Manchester Gemi Kanalı olarak kanalize edilmiş haliyle alır. Mersey, kanal tarafından Warrington'a kadar yapay olarak değiştirildi ve gelgit oldu. Runcorn'da, nehir büyük sol banka kolu Weaver'ı alır ve bölgede 30 kilometrekareden (75 mil kare) daha geniş bir haliç açar. Haliç, deniz kenarında sınırlandırılmış ve gelgit hareketlerinin silt birikmesini önleyecek ve böylece Liverpool Limanı'nın tarama maliyetlerini azaltacaktır. Haliçin bu bölümü üç kez tünellendi: iki yol tüneli (biri 1971'de açıldı) ve bir demiryolu tüneli Liverpool (kuzey) ile Birkenhead (güney) arasında bağlantı kurdu. Mersey, toplam 110 km'lik bir yoldan sonra İrlanda Denizi'ne girer.