Yeni virüs suşlarının gelişimi
Hayvanları enfekte eden virüsler, bir türden diğerine atlayabilir ve yeni konakta yeni, genellikle ciddi bir hastalığa neden olabilir. Örneğin, 2003 yılında Coronaviridae familyasından bir virüs, at nalı yarasalar olduğuna inanılan bir hayvan rezervuarından insanlara atladı ve şiddetli akut solunum sendromu (SARS) adı verilen insanlarda oldukça patojenik bir hastalığa neden oldu. SARS koronavirüsünün at nalı yarasalarından insanlara atlayabilme yeteneği şüphesiz virüsde genetik değişiklikler gerektirdi. At nalı yarasalarda bulunan SARS virüsü insanları doğrudan enfekte edemediğinden, değişikliklerin avuç içi miskinde meydana geldiğinden şüphelenilmektedir.
Bu tür yeni ortaya çıkan virüsler genellikle insanlarda oldukça bulaşıcıdır, çünkü daha önce insan bağışıklık sistemi tarafından görülmemiştir ve bu nedenle insanların bunlara karşı bağışıklığı yoktur. Örneğin SARS'a neden olan koronavirüs, insanlar arasında hızla yayılır ve önemli bir hastalık tehdidi haline gelir. Virüs, seyahat ve karantina önlemleri üzerindeki yasaklar nedeniyle hızla kontrol altına alındı. 2019'un sonlarında, SARS-CoV-2 adı verilen başka bir tür coronavirüs Çin'de ortaya çıktı ve bir pandemiye yol açarak dünya çapında hızla yayıldı. SARS-CoV-2, koronavirüs hastalığı 2019 (COVID-19) olarak bilinen ve SARS'a çok benzeyen ancak özellikle 65 yaşın üzerindeki kişilerde önemli ölçüde daha fazla mortaliteye neden olan bir hastalığa neden oldu.
İnfluenza İnsanları enfekte eden bir virüs, pandemiye neden olan virüsler üreten antijenik kayma adı verilen dramatik bir antijenik değişikliğe uğrayabilir. Bu dramatik değişiklik, influenza A virüslerinin büyük bir hayvan rezervuarına, vahşi su kuşlarına sahip olması nedeniyle oluşur. İnfluenza A virüslerinin RNA genomu sekiz segment formundadır. Bir ara konak, muhtemelen domuz, aynı anda bir insan ve bir kuş gribi A virüsü ile enfekte olursa, genom RNA segmentleri yeniden aktive edilebilir, bu da immünolojik olarak influenza A virüslerinden farklı bir yüzey proteinine sahip yeni bir virüs verir. insan nüfusu içinde dolaşıyor. İnsan nüfusunun yeni virüse karşı çok az immünolojik koruması olacağı veya hiç olmayacağı için, bir pandemi ortaya çıkacaktır. Muhtemelen 1957 grip salgını, 1968 grip salgını ve 2009 grip salgını (H1N1) 'da meydana gelmiştir.
Pandemik influenza A virüsleri de farklı bir mekanizma ile ortaya çıkabilir. 1918-1919 influenza salgınına neden olan suşun, sekiz RNA segmentinin tümünü bir kuş virüsünden türediği ve bu virüsün daha sonra memeli hücrelerine adaptasyon sürecinde birden fazla mutasyona uğradığı varsayılmıştır. 1990'lardan bu yana Asya'dan Avrupa ve Afrika'ya yayılan kuş gribi virüsleri bu yolu pandemik kapasiteye taşıyor gibi görünmektedir. Tavuklardan insanlara doğrudan bulaşan bu virüsler sadece kuş genleri içerir ve insanlarda yüksek oranda patojenik olup yüzde 50'den daha yüksek bir ölüm oranına neden olur. Kuş gribi virüsleri henüz insanlardan insana etkili bir şekilde bulaşma kabiliyeti kazanmamıştır ve bunun için hangi genetik değişikliklerin yapılması gerektiği bilinmemektedir.
