Uygunluk, bir molekül içindeki atom gruplarının tekli bağlar etrafında dönmesinden kaynaklanan sonsuz sayıda olası uzaysal düzenlemeden herhangi biri.
protein: Arayüzlerdeki proteinlerin konformasyonu
Hem hidrofilik hem de hidrofobik gruplara sahip diğer birçok madde gibi, çözünür proteinler hava arasındaki ara yüze göç etme eğilimindedir
Tek bir kovalent bağın, her birinde söz konusu tek bağın ekseni boyunca en az bir atomun bulunmadığı iki çok atomlu grubu bağladığı herhangi bir molekül için farklı konformasyonlar mümkündür. Bu tür en basit molekül, iki hidroksil grubunun oksijen-oksijen bağının ekseni etrafında birbirlerine göre dönebildiği hidrojen peroksit molekülüdür. Bir birden fazla bu tür tek bağın bulunması moleküle-olarak bu propan (CH 3 -CH 2 -CH 3), örneğin-yalnızca doğası değiştirmeden durumun karmaşıklığını ekler. Siyanojen (N≡C ― C≡N) veya butadiyne (H ― C≡C ― C≡C ― H) gibi moleküllerde, tüm atomlar merkezi tek bağın ekseni boyunca uzanır, böylece ayırt edilemez uyumlar olmaz var olmak.
Genel olarak, bir molekülün her ayırt edilebilir konformasyonu, yapının farklı bölümleri arasındaki mesafelerle değişen çekici veya itici kuvvetlerin çalışması nedeniyle farklı potansiyel enerji durumunu temsil eder. Eğer bu kuvvetler olmasaydı, bütün uyumlar aynı enerjiye sahip olacaktı ve tek bağın etrafında dönme tamamen serbest ya da sınırsız olurdu. Kuvvetler güçlü ise, farklı konformasyonlar enerji veya stabilite açısından büyük ölçüde farklılık gösterir: molekül normalde kararlı bir duruma (düşük enerjiden biri) sahip olacak ve sadece kararsız müdahaleye ulaşmak ve geçecek yeterli enerjiyi emerek başka bir kararlı duruma geçecektir. konformasyon.
Örneğin, etandaki molekül içi kuvvetler o kadar zayıftır ki, varlıkları yalnızca entalpi ve entropi gibi termodinamik özellikler üzerindeki ince etkilerden çıkarılabilir. (Etandaki iç rotasyon ciddi şekilde kısıtlanmış olsa bile, en kararlı üç konformasyonu ayırt edilemez.) Bununla birlikte, bazı daha karmaşık bileşiklerin moleküler yapıları, stereoizomerik formların - sadece konformasyonda farklılık gösteren - dönmeye karşı bu kadar güçlü engeller uygular. izole olmak.
