Farklı sanatsal sunumlarda, Angkor Wat'ın merkezi binası, 19. yüzyıldan beri, Kamboçya üzerindeki Fransız korumasının ilk günlerinde Khmer ulusal bayraklarında ortaya çıktı. İlk bayrak maviyle çevrelenmiş, beyaz tapınak ile sınırlanmıştır. Bayrak, 1948'de koyu mavi, kırmızı ve koyu mavi eşit olmayan yatay çizgiler benimsenerek “modernize edildi” ve tapınak orijinaline daha yakın olacak şekilde değiştirildi. Bu bayrak Kamboçya bağımsız olduktan sonra da kullanılmaya devam etti. Ancak monarşinin sonu ve Khmer Cumhuriyeti'nin ilanı Ekim 1970'te yeni bir bayrakla sonuçlandı. Alan üç beyaz yıldızla mavi iken “çekirdek bayrak” kanton haline geldi.
Komünist isyancılar ilk olarak 1948-70 bayrağını kullandı ancak Nisan 1975'te düz kırmızı bir bayrak altında iktidara geldi. Demokratik Kampuchea, anayasasını Ocak 1976'da kabul ettiğinde, kırmızı bayrakın ortasına üç kuleli sarı tapınak silueti yerleştirildi, bunun yerine Vietnam destekli güçler Kampuchea Halk Cumhuriyeti ilan edildiğinde beş kuleli sarı bir tapınakla değiştirildi. Rakip “Kamboçya Devleti” (Khmer Rouge) ve “Kamboçya” (Vietnam) hükümetleri, Birleşmiş Milletler yönetiminden önce, merkezdeki ülkenin siluet haritasına sahip açık mavi bir bayrakla geçen daha fazla bayrak uyarlaması kurdular. Birleşmiş Milletler sivil çekişmeye son verilmesine yardımcı oldu ve 1993'te ülkeyi serbest seçimlere götürdü. 1948–70 bayrağı yine o yılın 30 Haziranında kaldırıldı.
