John Knowles Paine, (9 Ocak 1839 doğumlu, Portland, Maine, ABD - 25 Nisan 1906, Cambridge, Mass.), Besteci ve org, besteci ve ilk müzik profesörü olarak geniş çapta tanınan ilk Amerikalı bir Amerikan üniversitesi.
Portland'da kapsamlı bir müzikal temele sahip olan Paine, eğitimini Berlin'de (1858-61) tamamladı. 1861'de Boston'da 1862'de Harvard Üniversitesi'nde müzik eğitmeni (daha sonra profesör) olarak atanmasına yol açan bir dizi organ resitali ve konferansı başlattı. Orada düzenlediği müzik bölümü diğer birçok Amerikan üniversitesinin modeli oldu.
Hem öğretmen hem de besteci olarak ABD'deki müziğin gelişimi üzerinde büyük bir etkiye sahipti. Genellikle Alman klasikleri üzerinde modellenen eserleri arasında iki senfoni, bir Mass in D (1866-67) ve oratorio St. Peter (1872) bulunmaktadır.
