El-Kaide operasyonel bir planlayıcısı olarak, özellikle de 11 Eylül saldırılarının en yüksek profilli terörist operasyonlarını beyni yapan İslamcı militan Halid Şeyh Muhammed (1 Mart 1964 veya 14 Nisan 1965, Kuveyt doğumlu) 2001 yılında Dünya Ticaret Merkezi ve Pentagon'da.
Doğumundan önce Muhammed'in ailesi Pakistan'ın Belucistan eyaletinden Kuveyt'e göç etti. Muhammed Kuveyt'te büyüdü, orada devlet lisesine gitti ve gençken Müslüman Kardeşler üyesi oldu. 1983'te Murfreesboro, Kuzey Carolina'daki Chowan Koleji'ne (şimdiki Chowan Üniversitesi) gitmek için Amerika Birleşik Devletleri'ne taşındı. Kuzey Carolina Tarım ve Teknik Devlet Üniversitesi'ne geçti ve 1986 yılında makine mühendisliği derecesini aldı. Mezun olduktan sonra Muhammed, o ülkenin Sovyet işgali sırasında terörist eğitim aldığı düşünülen Afganistan'a gitti.
Daha sonra 1993 Dünya Ticaret Merkezi bombalamasının sorumluluğunu üstlenmesine rağmen, Muhammed ilk önce Muhammed'in yeğeni Ramzi Yousef tarafından yapılan ölümcül ve çılgınca hırslı bir plan olan Bojinka Arsa'sına katılımından dolayı uluslararası ilgi gördü. Manila'da bulunan komplocular, ABD'ye bağlı 11 transpacific uçağı neredeyse tespit edilemeyen bombalarla havaya uçurmayı amaçladı. Planın diğer unsurları Papa II. John Paul, US Pres. Bill Clinton ve sivil nükleer santraller. Filipin yetkililer, 1995 yılının Ocak ayında Yousef ve konfederasyon Abdul Hakim Murad'ın bomba inşa ettiği Manila dairesinde bir yangın başladığında olay örgüsünü keşfettiler. Murad daireye döndüğünde tutuklandı. Yousef ülkeden kaçtı ancak Şubat 1995'te Pakistan'da yakalandı ve ABD'ye iade edildi.
Bojinka Parlamasının önerilen bir yönü, bir uçağı kaçırmayı ve Merkezi İstihbarat Teşkilatı'nın (CIA) karargahına saldırmak için bir füze olarak kullanmayı içeriyordu. Muhammed bu planı 1996'da ABD'deki sembolik hedeflere saldırmak için kullanılması önerisiyle Usame bin Ladin'e götürdü. Bin Ladin'in planın 1998'in sonlarında veya 1999'un başında bir noktada onayladığına ve Muhammed'in El Kaide ile resmi ilişkisine başladığına inanılıyor. Muhammed bin Ladin ve Muhammed Atef ile birlikte korsanların takımlarını toplamaya başladı. Aralık 1999 başında Muhammed, 11 Eylül saldırılarını gerçekleştirecek olan üç El Kaide operatörü ile bir eğitim toplantısı düzenledi.
Bu saldırılardan sonra El Kaide içindeki Muhammed'in kaçağı fırladı. 22 Aralık 2001'de yolcular tarafından engelleyen bir Amerikan Havayolları jetinin “ayakkabı bombardımanı” girişimi de dahil olmak üzere Amerika Birleşik Devletleri'ne karşı başka komplolarda yer aldı. Muhammed ayrıca The Wall Street Journal muhabiri Daniel'in kafasını çektiğini iddia etti. Pearl, daha sonra bağımsız kaynaklar tarafından doğrulanan bir iddia. 2003'ün başlarında Muhammed, Londra'daki Heathrow Havalimanı'na bir saldırı planlıyordu, ancak olay ABD ve müttefikleri tarafından bozuldu. Kısa bir süre sonra, 1 Mart 2003 tarihinde, Pakistan Rawalpindi'deki ABD ve Pakistan subayları tarafından yakalandı.
CIA tarafından soruşturulması sırasında Muhammed 180 defadan fazla su kayağına maruz kaldı. Orta Avrupa'da sınıflandırılmış CIA “kara şantiye” cezaevlerinde birkaç yıl geçirdikten sonra 2006 yılında Guantánamo Körfezi gözaltı kampına transfer edildi. 11 Şubat 2008'de Muhammed ve diğer dört kişi askeri mahkeme sistemi altında Eylül ayına ilişkin suçlarla suçlandı 11 saldırı. Yargılama duruşmasında Muhammed, ABD'ye karşı düzinelerce farklı arsadaki rolünü itiraf etti ve Haziran 2008'deki düzenlenmesi sırasında kendini temsil etmek ve suçlu olmak istediğini açıkladı. Kasım 2009'da ABD Başsavcısı Eric Holder, Muhammed'in ve dört danışmanının ABD'ye transfer edileceğini ve New York'ta bir sivil mahkemede yargılanacağını açıkladı. Ocak 2010'da Muhammed'e karşı askeri suçlamalar resmi olarak Pentagon tarafından düşürüldü ve sivil yargılamaların devam etmesinin önünü açtı. Ancak Nisan 2011'de Tutucu, Kongre'nin getirdiği kısıtlamalar nedeniyle Muhammed'in sivil bir ortamdan ziyade bir askeri mahkemede yargılanacağını duyurdu. Savunma Bakanlığı Muhammed aleyhindeki suçlamaları yeniden doldurdu ve Mayıs 2012'de ikinci kez tutuklandı. Duruşmayı bekleyen Guantánamo Körfezi'nde hapsedildi.
